Budi Raharjo memiliki latar belakang pendidikan di Bidang Aquaculture dari Institute Pertanian Bogor pada program sarjana dan Stirling University, Skotlandia pada program master yang ia dapatkan dari beasiswa British Council. Budi memiliki keahlian khusus dalam manajemen pemangku kepentingan (pemerintah dan Lembaga donor) melalui monitoring dan evaluasi program kolaboratif, serta pelaporan dan diseminasi dokumen pelaksanaan program. Ia berpengalaman dalam mengelola dan mengevaluasi berbagai program pembangunan pedesaan dan perkotaan yang dikelola oleh pemerintah dan NGO Internasional, seperti penyediaan air bersih dan sanitasi berbasis masyarakat, pembangunan ekonomi dan pendidikan lingkungan, yang mencakup juga pengembangan dan desain proposal, perencanaan implementasi tahunan program (dan penganggaran). Selain itu Budi juga memiliki pengalaman dalam melakukan evaluasi dalam beberapa program lainnya di bidang pendidikan, perlindungan terhadap anak-anak serta manajemen penanggulangan bencana.
Pengalaman menjadi bagian dari tim manajemen di beberapa organisasi seperti The Samdhana Institute, Save the Children UK, CARE International Indonesia. Selain itu Budi juga memiliki pengalaman konsultan dalam beberapa program di organisasi, seperti UNICEF, UNDP, BAPPENAS, CARE International Indonesia, World Bank, GIZ, USAID, Yayasan Bina Integrasi Edukasi, dan Masyarakat Penanggulangan Bencana Indonesia.